Science埃博拉测序公布 6作者去世

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Genomic surveillance elucidates Ebola virus origin and transmission during the 2014 outbreak

Science 埃博拉测序公布 6 作者去世

来自哈佛大学,Broad 研究院等多处科研机构的研究人员对超过 99 个埃博拉病毒基因组进行了测序和分析,这些发现将有助于研发现场快速诊断方法。58 名作者 6 名作者付出了生命的代价,上图红框作者。

这一研究成果公布在 8 月 29 日 Science 杂志在线版上。

埃博拉(Ebola virus)是一种十分罕见的病毒,由于其是在苏丹南部和刚果(金)的埃博拉河地区发现,因而得名。今年 2 月从西非国家几内亚开始的新一轮埃博拉疫情呈现出加速蔓延之势,迄今已有 1400 多人死亡,约 2600 人染病。

在最新这项研究中,研究人员收集了此次疫情爆发后第一天里,来自 78 位塞拉利昂地区被诊断为埃博拉病毒感染的患者的 99 个样品(部分患者提供了多个样品,这样研究人员就能更加清楚领导了解这种病毒从个人传播散发开来后发生的变化)。

研究人员在其中发现了超过 300 个基因突变,这些突变令 2014 年埃博拉病毒基因组与引发之前埃博拉疫情的病毒区分开来。同时研究人员也从测序样本中发现 EVD 是由单个进入人体的病毒发生突变,开始爆发传播,传染给许多人的。

埃博拉病毒出现的突变主要集中在基因组外显子,也就是编码蛋白的区域,这项研究发现的一些遗传突变也许会影响到 PCR 诊断试剂中的引物,这表明基因组监控的重要性,以及随时保持警惕的需要。

为了促进这一病毒研究发展,这一研究组的研究人员在 NCBI 上公布了基因组全长序列,这样全球的科学家们就能共享这一信息。

过去的埃博拉病毒感染的爆发局限于中部非洲,但 2014 年的爆发则是从西非国家几内亚开始的,并接着蔓延至塞拉利昂、利比里亚和尼日利亚。

此次获得的基因组是通过深度测序技术完成的,将能提高埃博拉病毒四倍以上的基因组数据信息。研究人员还将 2014 年 EBOV 的测序数据与早些时候的 EBOV 爆发的 20 个基因组进行了比较,结果发现今年爆发的病毒可能与之前的疫情病毒具有一个共同的祖先,可以追溯到第一次 1976  年的埃博拉病毒爆发。

研究人员表示,与过去爆发的疫情相比,此次病毒爆发始于某单个人体病毒的交换突变,然后再通过持续的人与人的相互交往而传播,从高将来自几内亚的 2 个 EBOV 病毒系传播到了塞拉利昂。

这些研究结果还表明,在疾病流行期间对病毒基因组进行快速测序,能有助于疾病健康和靶标治疗,虽然目前这些序列还没有临床上的实际意义,但是这对于解析这种病毒,遏制其进一步传播至关重要。

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