动物基因组DNA的提取

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动物基因组 DNA 的提取

[实验原理]

    EDTASDS等去污剂存在下,用蛋白酶 K 消化细胞,随后用酚抽提,可以得到哺乳动构基因组 DNA,用此方法得到的DNA 长度为100-150
kb
,适用于 L 嘴菌体构建基因组文库和 Southern 分析。

    通过本实验了解并掌握提取基因组 DNA 的原理和步骤,以及相对分子质量较大的 DNA 的 琼脂糖凝胶电泳技术。

[仪器、材料与试剂]

() 仪器

1.台式离心机

2.玻璃匀浆器

3.高压灭菌锅

4.恒温水浴

() 材料

11.5mL微量离心管

2.微量取样器和吸头

3.无菌过滤器 ( 一次性)

410 mL注射器

5.鼠肝

6.三羟甲基氨基甲烷(Tris)

7.十二烷基硫酸钠(SDS)

 8.乙二胺四乙酸(EDTA)

 9.蛋白酶K

10RNA

11DNA相对分子质量标准物,DNA/EcoRI+HindⅢ相对分子质量标准物

 () 试剂

11.5 mol/L    NaCl

20.5 mol/L Tris·HCI    pH8.0

30.5 mol/L EDTA    pH8.0

43 mol/L
NaAc    pH5.2

 以上均高压灭菌。

5.蛋白酶 K  10mg/mL 配好后用一次性过滤器过滤,-20  保存 ( 教师配制)

6.组织匀浆液  100mmol/LNaCI10mmol/LTris·HCl(pH 8.0)0.25mmol/LEDTA(pH8.0)

7.酶解液   200mmol/LNaCI20mmol/L Tris·HCI(pH 8O)50mmol/LEDTA(PH 8.0)200~g/mL 蛋白酶K1%SDS

8.无 DNA 酵的 RNA
:将胰 RNA 酶溶解于 10mmol/L Tris.HCI(pH7.5)15 mmol/L  NaCl 溶液中,浓度 l0mg/mL,于100 水浴处理 15min,以降解DNA 酶,缓慢冷却到室温,-20保存

9TE缓冲液:10mmol/LTris·HCl(pH8.0)25 mmol/LEDTA(pH8.0)

10.平衡酚 (pH8.0):氧仿:异戊醇=25241< 体积比)

11.氧仿:异戊醇 =24l( 体积比)

125xTBE  54gTris275g硼酸 
2mL 0.5mol
/L EDTA(pH8.0),加水到100mL

136x上样缓冲液   o25%溴酚蓝,40%(W/V) 蔗糖水溶液

14.λDNA/EcoRI+/HindⅢ 相对分于质量标准物片段(bP)21 22751484 9734 2683 5302 0271 9041 5841 315947831564125

[实验步骤]

    本实验在无液氮的条件下,铡备鼠肝 DNA,与有液氮条件下相比,产量和质量都有所下降。整个操作过程中,应尽量避免DNA 酶的污染,特 g4 注童动作温和,减少对 DNA 的机械捌伤。

1、取 0.2g 鼠肝,用冰冷的生理盐水洗 3 次,然后置于 2.0mL 匀浆掖中,用玻璃匀浆器匀浆至无明显组织块存在 ( 冰浴操作,切匆将细胞破碎,可镜检观察)

2、将组织细胞移至 1.5ml 离心管中,50000rpm离心 30-60sec( 尽可能在低温下操作 ),弃上清,若沉淀中血细胞较多,可再加入1 倍于细胞体积的匀浆液洗一次。

3、沉淀加 0.8mL 无菌水迅速吹散,分两管,再加 0.4mL 酵解液,翻转混匀 ( 动作一定要轻 )55 水浴处理 12-18 h

4、沉淀加 RNase 至终浓度 200µg/mL37 水浴1 h

5、加入等体积酚/氯仿/异戊醇抽提一次,(慢慢旋转混勾,倾斜使两相接触面增大 )410min10000rpm 离心;

6、有时如果 DNA 含量过高,水相在下层,实验时应注意观察。用扩口吸头移出含 DNA 的水相 ( 注意勿吸出界面中蛋白沉淀),加等体积氧仿/异戊醇,4

10 000rrpm离心 10rain ( 若界面或水相中蛋白含量多,可重复 16 操作)

7、用扩口吸头小心吸出上层含 DNA 的水相,加 1/10 体积的 NaAc,小心混匀( 要充分 ),再向每管中加入2.5 倍体积的无水乙醇,-20  过夜。

812 000rpm离心 19min,弃上清,75%冷乙醇洗涤一次,12000rpm 离心 15min 室握温干燥 ( 不要大干,否则 DNA 不易溶解 ),加入适量TE 缓冲液,存放于4,轻摇溶解过夜,即可得 到实验动物基因组DNA

9、电泳鉴定 DNA,由于基因组DNA 相对分子质量较大,用 0.3%的琼脂糖凝胶电泳鉴定,先在底部锦一层1%的支持胶,凝固后再铺上一层0.3%琼脂糖凝胶,插上梳子( 枚子不能瑾到的支持胶 )。取1.5µL 溶解的 DNA1µL 上样缓冲液和 35µl 无菌水混匀后小心上样 ( 可在另一孔加 DNA 相对分于质量标准 ),观察基因组DNA 大小,用溴化乙锭染色观察结果。

[注意事项]

1、操作过程尽量在低温下进行,避免 DNA 降解。

2、琼脂糖凝胶脆弱,应小心操作。

3、提取得到的基因组 DNA 应为单一条带,DNA降解可形成弥散带型。


正文完
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