Cell Ranger安装和使用教程

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Cell Ranger 系统要求:

  • 8-core Intel or AMD processor (16 cores recommended)
  • 64GB RAM (128GB recommended)
  • 1TB free disk space
  • 64-bit CentOS/RedHat 6.0 or Ubuntu 12.04

ssh 登录 Linux 系统;

设置安装目录

mkdir apps 
cd apps
下载解压 cell ranger

打开 https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/downloads/latest 填写信息获取 curl 下载链接

用 tar 命令解压

tar -zxvf cellranger-3.1.0.tar.gz

添加到系统路径

export PATH=/mnt/home/user.name/yard/apps/cellranger-3.1.0:$PATH

现在,您可以从任何目录在命令行上输入 cellranger 来查看用法说明。

正文完
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