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Cell Ranger 系统要求:
- 8-core Intel or AMD processor (16 cores recommended)
- 64GB RAM (128GB recommended)
- 1TB free disk space
- 64-bit CentOS/RedHat 6.0 or Ubuntu 12.04
ssh 登录 Linux 系统;
设置安装目录
mkdir apps
cd apps
下载解压 cell ranger
打开 https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/downloads/latest 填写信息获取 curl 下载链接
用 tar 命令解压
tar -zxvf cellranger-3.1.0.tar.gz
添加到系统路径
export PATH=/mnt/home/user.name/yard/apps/cellranger-3.1.0:$PATH
现在,您可以从任何目录在命令行上输入 cellranger 来查看用法说明。
正文完